配方施肥不仅直接表现在农作物增产效应上，还体现在培肥土壤，提高土壤肥力方面。平衡施肥结果，土壤养分降碍因子得以消除也是培肥标志之一。全国策二次土壤普查发现，辽宁省法库县大部分农田土壤有效磷低于5mg/kg，农作物产量始终徘徊在260-300公斤/亩之间。配方施肥技术推行以底全县化肥N:P2O5保持在1:0.5。多年实施结战农出土壤有效磷普遍恢复到1.5mg/kg左右，农作物产量水平也很快提高。沈阳市新城于区大辛二村4000亩农田，连续10年竖持有机肥、化肥配合施用，化肥抓配方，农肥抓秸秆直接还田和城粪，土壤有机质从1.6%提高到2.10％，土壤肥力提高很快。1980年前该村每年施用标准化肥360吨，玉米单产不越过500公斤，现在减少到每年施用化肥70吨，节省化肥投资18.7刀元，而玉米单产突破的600公斤。  河南省博爱县界沟乡连续五午施行配方施肥，全乡土壤肥力有明显提高，有机质增加0.21%，碱解氮增加1.4mg/kg，有效磷增加5.2mg/kg，有效钾增加1.8mg/kg，土壤理化性状得到改善。
      利用土壤养分速测仪进行配方施肥中，不论采取肥料效应函数法还是采取测土施肥法或养分平衡法，都足以确保实现农作物一定的目标产量决定施肥量施于土壤，一韶分供应农作物营养需要，一部分残留于土壤，使被农作物吸出的养分多于补做而且还有多余。以磷肥为例，20％被农作物吸收，80％残留，肯定会使土壤有效磷和全磷逐渐提高。氮肥是很活泼的营养元荔40％被农作物吸收利用，25％残留，35％损失，其残留部分似不能补偿农作物携出的印分，但可在施用有机肥料的情况下得以解决。有机肥纪的利用率20％，余下大部分以有机态残留。由此也可得到启示，要提高土壤氮素肥力，必须以提高土壤有机质含量为前提，由此可知，配方施肥不仅能带来明显的经济效益，而且还可提高土壤肥力，寓生态效益于其中。